Bioinformaticien de recherche Niveau 4 Data Manager

CHU Sainte-Justine

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profile Job Location:

Montreal - Canada

profile Monthly Salary: Not Disclosed
Posted on: 16 hours ago
Vacancies: 1 Vacancy

Job Summary

Job Description

Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est à un stade de maturité qui lui a permis grâce à la recherche dexcellence qui sy réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant de recevoir au cours de la dernière année des dons majeurs qui seront transformationnels et ouvriront dinnombrables perspectives pour la recherche en santé des enfants. Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine réunit une équipe de plus de 1200 personnes soit plus de 295 chercheuses et chercheurs dont plus de 160 en recherche clinique et plus de 580 étudiantes et étudiants aux cycles supérieurs et stagiaires de recherche postdoctorale œuvrant dans des domaines dexpertise multiples. Travaillant étroitement avec les équipes de soins du CHU Sainte-Justine cette communauté se dévoue à la recherche fondamentale clinique et translationnelle au sein de six axes de recherche.

Projet

Laboratoire de recherche du Dr Sébastien Jacquemont.

Sous la responsabilité du directeur du Dr S. Jacquemont le bioinformaticien/data-manager devra identifier annoter et analyser des variants génétique à partir de données de génotypage et de séquençage (exome et génome complet). Le projet explore limpact de variants génétiques sur la cognition le comportement et les traits psychiatriques et neurodéveloppementaux. Il devra également superviser le travail des autres bioinformaticiens du laboratoire et de tous les étudiants qui travaillent sur les données disponibles sur les serveurs. Il sera responsable de lorganisation des données de loptimisation des protocoles danalyse et des pipelines développés au laboratoire en collaboration avec les autres membres de léquipe.

Des responsabilités supplémentaires consistent en la gestion des actifs informationnels (applications web et serveurs) de léquipe la rédaction de documentation lassurance-qualité et lécriture des tests automatisés et la maintenance du code. Une volonté de travailler en étroite collaboration avec les membres de léquipe ainsi quavec nos collaborateurs est indispensable. Le candidat doit apprendre rapidement et volontairement avoir un excellent sens de lorganisation être capable de travailler de manière indépendante et de communiquer de façon efficace oralement et par écrit.

Tes défis

  • Identification annotation analyse de variants génomiques structurels. Les data à analyser comprennent des données de génotypage sur 800000 individus et des données de séquençage (exome et génome complet) sur environ 150 000 individus;
  • Supervision détudiants travaillant sur les données générées (accès partage et respect des bonnes procédures);
  • Gestion et coordination du travail en bio-informatique du laboratoire;
  • Développement et rédaction des procédures de traitement des données dans le laboratoire;
  • Organisation et hiérarchisation des données sur les serveurs (Compute Canada);
  • Concevoir optimiser et automatiser des pipelines danalyse sur des infrastructures locales et cloud (AWS Google Cloud);
  • Documentation et communication sur le processus danalyse résultats outils et techniques utilisés;
  • Interaction avec les membres du laboratoire afin délaborer des stratégies danalyses.

Tes acquis et talents

  • Niveau détudes : PhD en bioinformatique en génomique ou en informatique avec

  • Bonne connaissance des langages de programmation suivants : Bash Python R Hail Spark etc. ;

  • Bonne maîtrise des infrastructures cloud (AWS Google Cloud) ;
  • Une certaine expérience avec les bases de données relationnelles (MySQL PostgreSQL ElasticSearch).
  • Connaissance des méthodes statistiques de base et du langage R;
  • Excellente maîtrise du français et de langlais à loral comme à lécrit;
  • Solides connaissances en génétique;
  • Capacité de travailler en groupe sur plusieurs projets;
  • Bonne compétence en Data management ;
  • Expérience en gestion de projets et de personnel;
  • Expérience de travail sur les clusters de calculs.

Notre offre

  • Syndicat des employés du Centre de recherche du CHU Sainte-Justine (SECR)

  • Échelle salariale : Niveau 4 - entre 32.91 $ et 48.89 $ /heure (selon lexpérience de travail)

  • Chercheur responsable : Dr Sébastien Jacquemont
  • Poste : Régulier à temps complet (35 heures par semaine)
  • Date prévue dentrée en fonction : Dès que possible
  • Autre : Le candidat sera également appelé à se déplacer en fonction des besoins au Centre dInnovation de GQ/McGill.

Avis important

Nous tenons à préciser que les candidats étrangers devront avoir un permis de travail valide pour le CHU Sainte-Justine. Tout permis de travail ayant la condition suivante ne sera pas éligible : Pas autorisé à exercer un emploi relié aux soins des enfants à lenseignement au primaire ou au secondaire au domaine de la santé .

Veuillez utiliser notre site de recrutement pour postulez en ligne seuls les candidats retenus seront contactés.

Fin de laffichage : 3 février 2026

Autres avantages

1. Une conciliation travail et vie personnelle :

  • Plan de vacances avantageux
  • 20 jours de vacances par année 25 jours de vacances dès la fin de la période de probation
  • 13 jours fériés
  • 96 jours de maladie par année
  • Congé de maternité de paternité et dadoption

2. Des avantages collectifs concurrentiels :

  • Régime de retraite à prestations déterminées (RREGOP)
  • Assurances collectives pour vous et votre famille
  • Programme daide aux employés et à leur famille

3. Des établissements facilement accessibles* Station de métro Université-de-Montréal lignes dautobus et grands axes routiers à proximité* Abri à vélos sécurisé et stations BIXI à proximité* Située dans le quartier Côte-des-Neiges

4. Des services sur place pour vous simplifier la vie:

  • Centre de la petite enfance Sainte-Justine
  • Nettoyeur et service de couture
  • Activités sportives
  • Service alimentaire qui encourage lagriculture biologique et locale
  • Livraison de paniers de légumes biologiques

Remarques

Le genre masculin est utilisé sans discrimination et dans le seul but dalléger le texte. Le CHU Sainte-Justine souscrit au principe daccès à légalité en emploi et invite les femmes les membres des minorités visibles et des minorités ethniques les personnes handicapées et les Autochtones à poser leur candidature. Nous vous serions gré de nous faire part de tout handicap qui nécessiterait un aménagement technique et physique adapté à votre situation lors du processus de sélection. Soyez assuré que nous traiterons cette information avec confidentialité.


Required Experience:

Manager

Job DescriptionLe Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est à un stade de maturité qui lui a permis grâce à la recherche dexcellence qui sy réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant de recevoir au cours de la dernière année des dons maje...
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Key Skills

  • SQL
  • Data Collection
  • GCP
  • Master Data Management
  • R
  • Data Management
  • Clinical Trials
  • User Acceptance Testing
  • Data Warehouse
  • SAS
  • Oracle
  • Data Analysis Skills

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