Stage Analyse intégrée multi-omique des flux dantibiorésistance dans les STEP corrélation des données chimiques, microbiologiques et génomiques

Le stage est à pourvoir au sein de léquipe Monitoring et Caractérisation Biologique (MCB)

Titre du stage : Analyse du rôle des STEP dans les flux dantibiorésistance à léchelle des bassins versants

Dans le contexte marqué par lurgence de lutter contre lantibiorésistance (AR) de nouvelles exigences européennes imposent une surveillance des STEP >100 000 EH au regard de leur qualification comme points chauds de convergence des eaux usées chargées en bactéries résistantes bactéries pathogènes et en résidus dantibiotiques. Le/la stagiaire aura pour mission de développer une stratégie dexploitation des données existantes (chimie microbiologie génomique) pour analyser le rôle des STEP dans les flux dantibiorésistance à léchelle des bassins versants et identifier les facteurs déterminants de cette propagation.. Lobjectif est de compiler et structurer ces données hétérogènes puis détablir des corrélations entre les paramètres opérationnels et les données biologiques pour identifier les facteurs clés influençant les flux dantibiorésistance. 

Missions principales : 

• Recherche bibliographique : Réaliser une revue de la littérature sur lantibiorésistance dans les STEP et les bassins versants la gestion des données (format métrique en lien avec la réglementation européenne)

• Compilation et structuration des données : Collecter organiser et harmoniser les données existantes (chimie microbiologie génomique) et leurs métadonnées associées

• Analyse de corrélations : Corréler les données de séquençage avec les analyses chimiques et microbiologiques pour identifier les relations entre paramètres et comprendre les mécanismes de transfert horizontal de gènes

• Valorisation des résultats : Développer des visualisations et synthèses permettant dinterpréter le rôle des STEP dans les flux dantibiorésistance à léchelle des bassins versants

Qualifications :

Formation : Etudiant(e) en Bac4/5 (Master 1 ou 2) en biotechnologie Bioinformatique Data Science Data Management

Vos compétences :  

• Compétences en analyse de données et programmation (Python R)

• Connaissances en microbiologie et/ou génomique appréciées

• Capacités danalyse bibliographique et de synthèse

• Visualisation de données : Looker Studio Tableau

• Familiarité avec les formats de données courants en biologie (fastq pcrd images tables texte etc.)

Vos qualités votre savoir-être :

Communication : Bonne expression orale et écrite en français

Culture sécurité rigueur capacité à travailler en équipe dynamisme bon esprit de synthèse force de proposition / prise dinitiative sens de lorganisation

Informations supplémentaires :

Nos valeurs : 
Responsabilité Respect Solidarité Innovation Sens du client

Environnement de travail:

• Environnement stimulant

  • team buildings créativité innovation

  • croisement des expertises et des disciplines

  • des sujets de travail renouvelés pour découvrir et grandir

  • une vision large des enjeux et des activités de Veolia pour ressourcer le monde

  • un accompagnement pour se développer professionnellement

  • les opportunités dévolution au sein dun groupe mondial

En tant quentreprise inclusive Veolia sengage pour la diversité et accorde la même considération à toutes les candidatures sans discrimination. 

Pour postuler merci de joindre dans longlet pièces jointes CV et lettre de motivation en format PDF (nommés de la manière suivante : Nom PrénomCV et Nom PrénomLM)

En tant quentreprise inclusive Veolia sengage pour la diversité et accorde la même considération à toutes les candidatures sans discrimination. 

Remote Work :

No

Employment Type :

Full-time