Bioinformaticien (ne) de recherche Niveau 4 (Dr Lavallée)

Job Description

Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est à un stade de maturité qui lui a permis grâce à la recherche dexcellence qui sy réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant de recevoir au cours de la dernière année des dons majeurs qui seront transformationnels et ouvriront dinnombrables perspectives pour la recherche en santé des enfants. Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine réunit une équipe de plus de 1200 personnes soit plus de 295 chercheuses et chercheurs dont plus de 160 en recherche clinique et plus de 580 étudiantes et étudiants aux cycles supérieurs et stagiaires de recherche postdoctorale œuvrant dans des domaines dexpertise multiples. Travaillant étroitement avec les équipes de soins du CHU Sainte-Justine cette communauté se dévoue à la recherche fondamentale clinique et translationnelle au sein de six axes de recherche.

Projet - Professionnel en analyse de génomes complets des tumeurs pédiatrique par séquençage de troisième génération

Le laboratoire du Dr Vincent-Philippe Lavallée () clinicien-chercheur et directeur scientifique de la méta-plateforme de génomique intégrée du CHU Sainte-Justine utilise des technologies de séquençage de nouvelle génération dont le séquençage par Nanopore pour améliorer le diagnostic et la caractérisation moléculaire des cancers pédiatriques (). La recherche menée au laboratoire porte également sur lutilisation de biopsies liquides afin de détecter et suivre les marqueurs tumoraux de façon non invasive. Un volet important de la recherche porte sur la compréhension de lhétérogénéité tumorale un facteur clé dans la progression et la résistance aux traitements.

Grâce à son rôle dans les projets Leucégène et SIGNATURE le Dr Lavallée a accès à de large cohortes de patients adultes (AML) et pédiatriques ce qui permet dintégrer la recherche clinique et génomique à grande échelle afin didentier de nouvelles altérations responsables du développement de ces cancers.

Léquipe multidisciplinaire et hautement collaborative travaille étroitement avec la clinique et la plateforme de génomique pour accélérer le transfert des découvertes vers des applications concrètes pour les patients.

Tes défis

La personne sélectionnée aura lopportunité dœuvrer dans le domaine des technologies émergentes en -omics appliquées aux cancers pédiatriques dont la leucémie. Cette personne sera amenée à analyser et interpréter des données de cohortes utilisant le séquençage provenant de diverses méthodes en particulier par génome à longues lectures Nanopore tumoral et germinal. Le travail consistera à caractériser les altérations somatiques (SNV CNV fusion) dans les régions codantes et non codantes en travaillant à partir de génomes de référence et dassemblages de novo. Les données Omiques autres telles que le méthylome et le transcriptome seront à intégrer aux analyses afin de caractériser en détail des groupes de tumeurs. La recrue travaillera au développement et à la maintenance de linfrastructure informatique du laboratoire incluant la gestion des données ainsi quà la gestion et la coordination du travail en bio-informatique avec léquipe en place. Le/la titulaire effectuera aussi la coordination du travail local au laboratoire en bio-informatique en lien avec les approches -omics effectuées dans le laboratoire. Les tâches incluront également lanalyse de données pour des projets ciblés.

Sous la supervision du directeur du laboratoire et du personnel de recherche sénior le/la titulaire de ce poste a la responsabilité deffectuer les tâches suivantes :

• Analyser et interpréter de façon indépendante des jeux de données tels que des génomes complets générer des figures et publier les résultats;
• Développer linfrastructure informatique du laboratoire;
• Implémenter les pipelines couramment utilisés en génomique;
• Organiser prioriser et lancer les tâches sur les serveurs;
• Participer à la gestion de lentreposage des données;
• Devenir expert des contrôles de qualités et des méthodes danalyses des données de séquençage par Nanopore;
• Faire le lien avec le laboratoire humide et avec la plateforme de séquençage pour les aspects relatifs à lacquisition des données;
• Collaborer avec les groupes de recherche du centre de recherche du CHU Sainte-Justine du groupe Signature et du groupe Leucegene et présenter des résultats sur des questions biologiques précises;
• Collaborer étroitement avec les membres du laboratoire afin délaborer des stratégies danalyse pour différents projets ;
• Servir de personne ressource disponible et enseigner certains aspects de la bioinformatique aux nouveaux membres du laboratoire et aux collaborateurs;

Tes acquis et talents

• Doctorat en bio-informatique ou dans un domaine connexe tel que la biologie moléculaire combiné à une solide expérience de recherche appliqué à la génomique des cancers;

• Une maitrise avec expérience professionnelle substantielle dans le domaine dintérêt sera considérée.

• Démontrer une habilité à travailler en bio-informatique dans divers domaines de recherche
• Expertise démontrée en génomique à large échelle.
• Expérience en programmation et en calculs de haute performance (R python Linux/Unix Alliance de recherche numérique du Canada);
• Faire preuve de leadership et dautonomie dans son travail;
• Aptitudes de coordination ;
• Intérêt pour le travail en groupe et lenseignement
• Capacité à maintenir de très bonnes relations interpersonnelles;
• Curiosité face aux nouvelles technologies
• Grande capacité à travailler selon des dates de tombées serrées
• Maîtrise de langlais parlé et écrit aptitude en français parlé.

Notre offre

• Syndicat des employés du Centre de recherche du CHU Sainte-Justine (SECR)
• Échelle salariale : Niveau 4 - entre 32.91 $/hr et 48.89$/hr
• Chercheur responsable : Dr Vincent-Philippe Lavallée
• Poste : Régulier à temps complet (35 heures par semaine)
• Date dentrée en fonction : Dès que possible

Avis important

Nous tenons à préciser que les candidats étrangers devront avoir un permis de travail valide pour le CHU Sainte-Justine. Tout permis de travail ayant la condition suivante ne sera pas éligible : Pas autorisé à exercer un emploi relié aux soins des enfants à lenseignement au primaire ou au secondaire au domaine de la santé .

Veuillez utiliser notre site de recrutement pour postuler en ligne. Seuls les candidats retenus seront contactés.

Fin de laffichage : 23 mars 2026

Autres avantages

1. Une conciliation travail et vie personnelle :

• Plan de vacances avantageux
• 20 jours de vacances par année 25 jours de vacances dès la fin de la période de probation
• 13 jours fériés
• 96 jours de maladie par année
• Congé de maternité de paternité et dadoption

2. Des avantages collectifs concurrentiels :

• Régime de retraite à prestations déterminées (RREGOP)
• Assurances collectives pour vous et votre famille
• Programme daide aux employés et à leur famille

3. Des établissements facilement accessibles* Station de métro Université-de-Montréal lignes dautobus et grands axes routiers à proximité* Abri à vélos sécurisé et stations BIXI à proximité* Située dans le quartier Côte-des-Neiges

4. Des services sur place pour vous simplifier la vie:

• Centre de la petite enfance Sainte-Justine
• Nettoyeur et service de couture
• Activités sportives
• Service alimentaire qui encourage lagriculture biologique et locale
• Livraison de paniers de légumes biologiques

Remarques

Le genre masculin est utilisé sans discrimination et dans le seul but dalléger le texte. Le CHU Sainte-Justine souscrit au principe daccès à légalité en emploi et invite les femmes les membres des minorités visibles et des minorités ethniques les personnes handicapées et les Autochtones à poser leur candidature. Nous vous serions gré de nous faire part de tout handicap qui nécessiterait un aménagement technique et physique adapté à votre situation lors du processus de sélection. Soyez assuré que nous traiterons cette information avec confidentialité.