Ingénieur-e biologiste en traitement de données HF

Au cœur de lOncopole de Toulouse le CRCT avec tous ses partenaires (institutionnels universitaires cliniques industriels caritatifs) stimule linnovation en termes de recherche et denseignement dans la lutte contre le cancer.

Le CRCT conduit une approche intégrée entre la recherche les soins et lenseignement dans une logique transversale et multidisciplinaire. Il accueille 18 équipes de recherche très performantes et huit installations centrales regroupées au sein dun centre technologique.

La personne recrutée au sein de léquipe Network Biology for Immuno-oncology NetB(IO)² aura pour mission de collaborer à lanalyse de plusieurs ensembles de données disponibles dans léquipe en particulier à lanalyse des données de transcriptomique obtenus à partir dexpériences de co-culture cellulaire pour la création de simulations de ces systèmes sur ordinateur en utilisant les logiciels existants et en développant de nouveaux outils si nécessaire.

Catégorie : A

Corps : Ingénieur dEtudes

Emploi-type : A2A41 : Ingénieur-e en traitement de données

Rémunération : A partir de 2.42165 brut mensuel en fonction de lexpérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent

Pour en savoir plus :

• Sur lInserm : site RH: la politique handicap de lInserm et sur la mise en place daménagements de poste de travail contactez la Mission Handicap :

Activitésprincipales :

• Activités à la paillasse sur un système de co-culture de cellules in vitro
• Développement de codes pour la transcriptomique lanalyse de données omiques
• Développement de modèles mathématique pour la simulation de ces culture in silico

Léquipe NetB(IO)² est composée de plusieurs post-doctorants et doctorants ayant une formation mixte en biologie ou en sciences quantitatives ainsi que dun autre bio-informaticien et dun groupe indépendant de biologistes travaillant sur des expériences en laboratoire.

La personne recrutée va travailler en particulier sur une co-culture des cellules cancéreuse dans un microenvironnement tumoral.

Connaissances :

• Expérience en co-culture des cellules humaines
• Maîtrise du phénotypage cellulaire par FACS
• Connaissances théoriques en immunologie
• Expérience en analyses de données RNAseq
• Utilisation doutils bio-informatiques et travail en laboratoire de bio-informatique
• Expérience avec le logiciel PhysiCell pour la simulation des modèles individu-centrés (agent based) dinteraction cellulaire
• Compétences en science des données et statistiques
• Utilisation de systèmes dexploitation basés sur Unix
• Maîtrise des langages R python shell scripting avec une capacité à apprendre dautres langages de programmation
• Expérience avec Github et le versioning

Savoir-faire :

• Savoir synthétiser les résultats de recherche sur un document PowerPoint et le présenter à ses collègues
• Garantir la qualité et la pertinence des outils danalyse et des résultats
• Excellentes aptitudes à la communication orale et écrite en Anglais à lorganisation et à la gestion de projets

Aptitudes :

• Capacité à travailler de manière autonome tout en sintégrant pleinement dans une équipe pluridisciplinaire
• Savoir accueillir et intégrer les retours pour ajuster ses pratiques professionnelles et garantir une progression constante
• Faire preuve de solidarité et partage dexpertise en apportant un soutien aux autres collègues en cas de besoin
• Prioriser et planifier efficacement son travail pour respecter les échéances
• Faire preuve de rigueur
• Esprit dinitiative

Niveau de diplôme et formation(s) : M2 bio-informatique / biologie

Avantages :

• 32 jours de Congés Annuels et 13 jours de RTT
• Mutuelle santé collective obligatoire MGEN avec participation de lemployeur à hauteur de 50% pour le socle de base et à hauteur de 50% dans la limite de 5 pour les options
• Prévoyance collective facultative avec participation de lemployeur à hauteur de 7 pour le socle de base
• Restauration collective subventionnée sur place
• Comité daction sociale (prestations sociales culturelles sportives)
• Transports publics remboursés à 75%
• Forfait mobilité durable