Associé(e) de recherche Niveau 3 (Analyste en génomique) Dr Michaud

Job Description

Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est à un stade de maturité qui lui a permis grâce à la recherche dexcellence qui sy réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant de recevoir au cours de la dernière année des dons majeurs qui seront transformationnels et ouvriront dinnombrables perspectives pour la recherche en santé des enfants. Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine réunit une équipe de plus de 1200 personnes soit plus de 295 chercheuses et chercheurs dont plus de 160 en recherche clinique et plus de 580 étudiantes et étudiants aux cycles supérieurs et stagiaires de recherche postdoctorale œuvrant dans des domaines dexpertise multiples. Travaillant étroitement avec les équipes de soins du CHU Sainte-Justine cette communauté se dévoue à la recherche fondamentale clinique et translationnelle au sein de six axes de recherche.

Projet

Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine vise à recruter un professionnel de recherche en génomique ayant une solide expérience dans lanalyse et linterprétation des données génomiques afin de compléter léquipe qui pilote plusieurs projets de recherche majeurs centrés sur le développement et lévaluation de nouvelles modalités génomiques pour linvestigation des maladies génétiques rares.

Projet Care4Rare-Expand : étendre lutilisation de la génomique pour élucider les maladies rares

Faisant lobjet dune collaboration entre le Childrens Hospital of Eastern Ontario (CHEO Ottawa) Hospital for Sick Children (SickKids Toronto) Alberta Childrens Hospital (ACH Calgary) et les quatre centres hospitaliers universitaires pédiatriques du Québec (CHUSJ CUSM CHUS CHUQ) Care4Rare-Expand est lun des 12 projets de linitiative canadienne de soins de santé de précision lancé par Génome Canada. Ce projet denvergure nationale met en valeur le séquençage génomique ainsi que dautres technologies émergentes multi-omiques dans le but de diagnostiquer les maladies rares chez les Canadiens. Pour son volet québécois Care4Rare-Expand est financé par Génome Canada et Génome Québec avec une contribution de Santé Québec ainsi que de partenaires de lindustrie.

Projet DÉCODE(U)R: Déploiement Concerté dévaluations pour le Diagnostic de maladies rares et Ultra Rares

Le CHU Sainte-Justine et le SickKids ont mis sur pied un partenariat de recherche qui vise à transformer les soins pédiatriques via le développement de nouveaux paradigmes en santé de précision. Ce partenariat sans précédent dans lhistoire canadienne sappuie sur la création de synergies centrées sur lutilisation de technologies de pointe et le partage et lexploitation de grands jeux de données. DÉCODE(U)R est lun des projets de ce partenariat. Ce projet vise à évaluer lutilité diagnostique de nouvelles modalités génomiques pour linvestigation de patients avec maladies rares chez qui le séquençage de lexome ou du génome entier na pas permis de poser un diagnostic moléculaire.

Projet PRAGMatIQ : Pratique RApide de la GénoMIque pédiATrIque au Québec

Létude PRAGMatIQ qui vise à évaluer lutilité diagnostique et clinique ainsi que limpact économique du séquençage du génome entier sur le mode rapide chez des enfants hospitalisés en raison dune suspicion de maladies rares. Létude est financée par Génome Canada Génome Québec et par dautres organismes et met en jeu la participation des 4 centre hospitaliers universitaires pédiatriques du Québec (CHUSJ CUSM CHUS et CHUQ). Le recrutement étant terminé pour ce projet le candidat contribuera à lanalyse dun jeu de données de séquençage génomique à lecture longue de plus de 800 participants.

Le candidat retenu rejoindra une équipe multidisciplinaire qui coordonne ces projets en collaboration avec les équipes des laboratoires de diagnostic moléculaire du Réseau de santé québécois. Il sagira pour le candidat dune opportunité unique de mettre à profit ses compétences scientifiques au service de lavancement de la médecine génomique.

Tes défis

Sous la responsabilité de Dr. Jacques L. Michaud le professionnel de recherche devra identifier annoter et analyser des variants génétiques à partir de données de génotypage et de séquençage (génome complet et transcriptome - courte lecture et longue lecture). Le professionnel devra :

• Travailler avec une équipe de médecins scientifiques conseillers en génétique bio-informaticiens et coordonnateurs de recherche pour assurer lanalyse des données génomiques issues de divers projets de recherche ;
• Analyser les données de séquençage du génome et du transcriptome. Les données à analyser proviendront en partie du séquençage du séquençage courte (Illumina) ou longue (Revio/PacBio et Promethion/Nanopore) lecture du génome complet et du transcriptome;
• Interpréter et classer les variants génomiques et les profils de méthylation détectés chez les patients en regard de leur pertinence pour les maladies humaines en mettant à profit différents ressources (outils de prédiction de limpact fonctionnel des variants bases de données internes et externes etc);
• Interpréter les profils transcriptomiques des patients de façon à valider les variants dépissage et à mesurer le niveau dexpression de gènes candidats;
• Conserver une documentation complète et précise des procédures et des données analysées et des preuves à lappui et présenter les résultats aux équipes détude ;
• Rédiger des rapports de résultats destinés aux cliniciens requérants;
• Contribuer au développement et à la validation doutils dinterprétation des génomes et transcriptomes;
• Développer et maintenir des bases de données;
• Participer à lélaboration à la mise en œuvre et à lévaluation des initiatives en cours et émergentes;
• Participer à la formation détudiants;
• Participer à lélaboration de procédures opérationnelles à lévaluation de nouvelles technologies génomiques et aider à la rédaction des articles et publication des projets ;
• Sassurer de la bonne marche de létude du suivi du protocole et de la qualité des données.

Tes acquis

• PhD en génétique moléculaire ou dans un domaine connexe avec une expérience en analyse et interprétation de données génomiques;
• Expertise en génomique clinique et/ou certification du Collège Canadien des Généticiens Médicaux (CCMG) considérée comme un atout;
• Expérience en interprétation des variants génomiques et des lignes directrices relatives à linterprétation des variants et capacité à utiliser les bases de données outils et ressources génomiques pertinents pour linterprétation des données génomiques (par exemple UCSC gnomAD DGV ClinVar DECIPHER IGV) ;
• Familiarité avec les technologies génomiques diagnostiques;
• Capacité danalyse critique et dinterprétation de la littérature médicale/scientifique ;
• Proactif et capable de travailler de façon indépendante avec supervision minimale ;
• Capacité de travailler en groupe sur plusieurs projets ;
• Excellente gestion des priorités rapidité dexécution sens de lorganisation et gestion du temps ;
• Bonne compétence en communication orale et écrite.

Notre offre

Syndicat des employés du Centre de recherche du CHU Sainte-Justine (SECR)

Échelle salariale: Niveau 3 - entre 29.39$/hr et 43.64$/hr (Selon expérience demploi)

Chercheur responsable: Dr Jacques Michaud

Poste : Régulier à temps complet (35 heures par semaine)

Durée: Contrat à durée indéterminée

Date prévue dentrée en fonction : Immédiate

Fin de laffichage: 20 mars 2026

Important

Nous tenons à préciser que les candidats étrangers devront avoir un permis de travail valide pour le CHU Sainte-Justine. Tout permis de travail ayant la condition suivante ne sera pas éligible : Pas autorisé à exercer un emploi relié aux soins des enfants à lenseignement au primaire ou au secondaire au domaine de la santé .

*Autres avantages*

1. Une conciliation travail et vie personnelle :

• Plan de vacances avantageux
• 20 jours de vacances par année 25 jours de vacances dès la fin de la période de probation
• 13 jours fériés
• 96 jours de maladie par année
• Congé de maternité de paternité et dadoption

2. Des avantages collectifs concurrentiels :

• Régime de retraite à prestations déterminées (RREGOP)
• Assurances collectives pour vous et votre famille
• Programme daide aux employés et à leur famille

3. Des établissements facilement accessibles

• Station de métro Université-de-Montréal lignes dautobus et grands axes routiers à proximité
• Abri à vélos sécurisé et stations BIXI à proximité
• Située dans le quartier Côte-des-Neiges

4. Des services sur place pour vous simplifier la vie:

• Centre de la petite enfance Sainte-Justine
• Nettoyeur et service de couture
• Activités sportives
• Service alimentaire qui encourage lagriculture biologique et locale
• Livraison de paniers de légumes biologiques

Remarques

Le genre masculin est utilisé sans discrimination et dans le seul but dalléger le texte. Le CHU Sainte-Justine souscrit au principe daccès à légalité en emploi et invite les femmes les membres des minorités visibles et des minorités ethniques les personnes handicapées et les Autochtones à poser leur candidature. Nous vous serions gré de nous faire part de tout handicap qui nécessiterait un aménagement technique et physique adapté à votre situation lors du processus de sélection. Soyez assuré que nous traiterons cette information avec confidentialité.