Stage Bio-informatique

Sujet de stage  : Développement dun outil bioinformatique de traitement de données de séquençage NGS nanopore visant létude métagénomique de lantibiorésistance microbienne.

Missions 

Vos principales missions seront les suivantes : 

Au sein du Département des Expertises Scientifiques et Technologiques de Veolia léquipe Monitoring & Caractérisation contribue notamment à des projets transverses de développement de procédés biologiques innovants pour le traitement et la valorisation des déchets solides et des effluents liquides ainsi quà des projets de maîtrise de la qualité de leau ou doptimisation opérationnelle. Lactivité du Pôle sappuie sur des outils de Biotechnologies  développés sur des matrices complexes (approches métaomiques PCR quantitative microscopie) qui permettent de déterminer la composition des communautés biologiques et de quantifier certaines de leurs fonctions et activités.

Sous la responsabilité dun chercheur vous intégrez une/des équipe(s) projet. Vous disposez de solides connaissances scientifiques et techniques en microbiologie et biologie moléculaire des communautés microbiennes ainsi quen bio-informatique et vous aurez à votre charge les missions suivantes:

• Porter un regard critique sur les travaux engagés.
• Construire un outil fonctionnel entièrement maîtrisé et paramétrable pour le traitement de données de séquençage nanopore. 
• Réaliser une étude comparative entre les résultats obtenus avec loutil développé et ceux de solutions existantes.
• Présenter et expliciter  les travaux réalisés. 
• Rédaction dun rapport 

Qualifications :

En formation bac5 (Master 2ème année ou école ingénieur) ayant des bases solides en bioinformatique. Des connaissances en biologie moléculaire et en écologie microbienne seraient un atout majeur.   De bonnes capacités rédactionnelles et relationnelles sont requises. Nous recherchons des personnes dynamiques curieuses et rigoureuses.

Formation

Bac5 (Master 2ème année ou école ingénieur)

Compétences

Maîtrise des outils bioinformatiques appliqués à lenvironnement et/ou aux biotechnologies.

Séquençage NGS et traitements de données associées.

Utilisation de base de données.

Langages :  Bash R Python.
 

Qualités savoir-être

• Capacités à travailler en équipe
• Excellente communication
• Dynamisme et autonomie indispensables
• Sens de linnovation et curiosité
• Maîtrise du français et de langlais

Informations supplémentaires :

Nos valeurs : Responsabilité Respect Solidarité Innovation Sens du client

Environnement stimulant

• team buildings créativité innovation
• croisement des expertises et des disciplines
• des sujets de travail renouvelés pour découvrir et grandir
• une vision large des enjeux et des activités de Veolia pour ressourcer le monde
• un accompagnement pour se développer professionnellement
• les opportunités dun groupe mondial

En tant quentreprise inclusive Veolia sengage pour la diversité et accorde la même considération à toutes les candidatures sans discrimination. 

Remote Work :

No

Employment Type :

Full-time